mNGS病原微生物檢測(cè)解決方案
病原微生物可以侵犯人體，引起感染病或傳染病，一直備受臨床關(guān)注。新型冠狀病毒肺炎全球大流行，給世界經(jīng)濟(jì)和人類健康帶來(lái)嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，更讓病原的精準(zhǔn)快速檢測(cè)成為社會(huì)迫切的需求。
宏 基 因 組 測(cè) 序 （metagenomics next?generation sequencing，mNGS）是基于高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)各種臨床樣本中的全部生物基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)室診斷技術(shù)，與其它常見微生物鑒定方法相比具有通量大、可同時(shí)檢測(cè)上萬(wàn)種微生物等優(yōu)勢(shì)，近年來(lái)已逐漸應(yīng)用于各種感染性疾病的診斷，對(duì)不明原因的危急重感染的病原學(xué)診斷以及新發(fā)突發(fā)傳染病的病原體發(fā)現(xiàn)發(fā)揮了重要作用。
病原微生物宏基因組基于底層測(cè)序技術(shù)的高通量?jī)?yōu)勢(shì)，可一次性檢測(cè)出樣本中所有種類病原微生物測(cè)序數(shù)據(jù)，通過專門的病原數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)，獲得疑似致病微生物的種屬信息，為疑難危重感染提供快速精準(zhǔn)診斷依據(jù)。
mNGS檢測(cè)優(yōu)勢(shì)
為滿足臨床病原微生物的檢測(cè)，進(jìn)一步為疑難危重感染提供快速精準(zhǔn)的診斷依據(jù)，全式金推出樣本保存、宿主DNA去除、微生物核酸提取及DNA文庫(kù)構(gòu)建相關(guān)產(chǎn)品，提供宏基因組文庫(kù)制備的上下游整體解決方案。
樣本保存
TransGuard? Disposable Virus Sampling Tube
? 滅活病毒，有效防止運(yùn)輸和檢測(cè)過程中出現(xiàn)二次污染。
? 保存穩(wěn)定，常溫下保存一周病毒核酸不降解。
? 常溫下運(yùn)輸和保存，無(wú)需冷鏈。
? 檢出率高，可兼容多種病毒核酸提取試劑。
? 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需經(jīng)過專業(yè)培訓(xùn)，可自行采樣。
TransGuard? Fecal DNA Sampling Tube
? 安全滅活，有效防止運(yùn)輸和檢測(cè)過程中的二次污染。
? 保存穩(wěn)定，常溫下保存 3 個(gè)月樣本核酸不降解。
? 常溫下運(yùn)輸和保存，無(wú)需冷鏈。
? 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需經(jīng)過專業(yè)培訓(xùn)，可自行采樣。
TransGuard? Buccal Swab DNA Preservation Buffer
? 安全滅活，有效防止運(yùn)輸和檢測(cè)過程中出現(xiàn)二次污染。
? 保存穩(wěn)定，常溫下保存 6 個(gè)月樣本核酸不降解。
? 常溫下運(yùn)輸和保存，無(wú)需冷鏈。
? 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需經(jīng)過專業(yè)培訓(xùn)，可自行采樣。
宿主核酸去除
TransNGS? Host DNA Depletion Kit
本產(chǎn)品適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等生物樣品中差異性裂解人源細(xì)胞，并去除人源核酸。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
? 簡(jiǎn)便省時(shí)：操作簡(jiǎn)便，50 min完成人源宿主核酸去除。
? 高效去除：專用裂解液，高效去除人源宿主核酸，提高微生物檢出率。
? 兼容多種提取平臺(tái)：可兼容柱提法及磁珠法等多種下游提取方式。
? 適用樣本范圍廣：適用于血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等多種生物液體樣本。
高效去除宿主核酸
分別使用TransGen 、Company V和Company Q同類產(chǎn)品處理不同樣本，搭配各自適配的柱提法病原微生物核酸提取產(chǎn)品提取核酸，并對(duì)宿主保守基因進(jìn)行qPCR定量檢測(cè)。結(jié)果表明： TransGen 產(chǎn)品可以有效清除宿主核酸，且清除效率顯著優(yōu)于 Company V 和 Company Q 同類產(chǎn)品。
適用于建庫(kù)分析，提高微生物檢出水平
分別以咽拭子、痰液、腹水和胸水去除宿主核酸后提取的產(chǎn)物為樣本，進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建及 PE150 測(cè)序分析。結(jié)果顯示，TransGen 產(chǎn)品可以顯著降低宿主序列占比。
以 TransGen 、Company V 和 Company Q 產(chǎn)品去除咽拭子宿主核酸前、后提取的產(chǎn)物為樣本，進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建及 PE150 測(cè)序分析。結(jié)果顯示，TransGen 產(chǎn)品可以顯著提高微生物檢出水平。
核酸提取
EasyPure? Microbiome DNA Isolation Kit
本產(chǎn)品采用硅膠膜離心柱特異吸附微生物DNA，分離富集的DNA適用于多種下游應(yīng)用，包括PCR、qPCR、宏基因組或16S rDNA文庫(kù)構(gòu)建等實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
? 高質(zhì)量、高得率滿足多種下游檢測(cè)需求。
? 嚴(yán)控試劑背景菌污染，降低假陽(yáng)性風(fēng)險(xiǎn)。
? 提取效果好，高、低濃度模板均能獲得高效提取。
? 適用于從適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等樣本中提取微生物DNA。
將高、低兩種起始量的不同病原菌稀釋液添加至咽拭子、痰液、胸水、腹水樣本中，分別使用TransGen 、Company V 和 Company Q 產(chǎn)品提取核酸，qPCR 檢測(cè)提取效果。結(jié)果表明：TransGen 產(chǎn)品對(duì)不同樣本中不同微生物的提取效率均優(yōu)于競(jìng)品。
MagicPure? 32 Microbiome DNA Isolation Kit
本產(chǎn)品利用硅基磁珠特異性吸附微生物DNA，獲得的DNA適用于多種下游應(yīng)用，包括PCR、qPCR、? 宏基因組或16S rDNA文庫(kù)構(gòu)建等實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
? 高通量提取，操作簡(jiǎn)便，速度快。
? 高質(zhì)量、更高得率滿足多種下游多種檢測(cè)需求。
? 更低的試劑背景降低假陽(yáng)性風(fēng)險(xiǎn)。
? 適用于32通道磁棒式自動(dòng)化核酸提取儀。
? 適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等樣本中提取微生物DNA。
將高、低兩種起始量的不同菌種稀釋液添加至咽拭子、痰液、胸水、腹水樣本中，使用 TransGen 柱提法和磁珠法產(chǎn)品提取核酸，qPCR 檢測(cè)提取效果。結(jié)果表明，TransGen 磁珠法與柱提法產(chǎn)品均可對(duì)高、低起始量樣本進(jìn)行高效提取。
文庫(kù)構(gòu)建
TransNGS? Microbiome DNA Library Prep Kit for Illumina?
針對(duì)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)開發(fā)的，適用于1 ng從血液、肺泡灌洗液、痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等生物樣品中獲取的微生物基因組DNA進(jìn)行文庫(kù)制備的試劑盒。
產(chǎn)品特點(diǎn)：
? 建庫(kù)用量低：僅需1 ng DNA即可建庫(kù)。
? 適用樣本廣泛：血液、痰液、鼻咽或口咽拭子等多種來(lái)源的樣本DNA均可達(dá)到較好的建庫(kù)效果。
? 建庫(kù)時(shí)間短：90 min即可完成文庫(kù)構(gòu)建。
? 無(wú)偏好性：建庫(kù)測(cè)序結(jié)果與預(yù)期一致。
宏基因組建庫(kù)原理圖
多樣本建庫(kù)峰型
使用 TransGen 和 Company V 產(chǎn)品分別以 1 ng 口咽拭子、痰液和血液的基因組為樣本進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建。
臨床模擬樣本建庫(kù)
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